低聚糖主要分为大豆低聚糖、异麦芽低聚糖、低聚果糖、低聚木糖和低聚甘露糖等。比如异麦芽低聚糖，以淀粉为原料，用α－淀粉酶液化，再用β－淀粉酶糖化，同时用葡萄糖苷转移酶转化麦芽糖，成为异麦芽糖低聚糖。大豆低聚糖以脱脂后的豆粕（高温、低温）为原料，利用大豆低聚糖固有的物理特性纯天然物理方法提取，两者利用不同的生产工艺。前者用酶法提取，水苏糖（4糖）、棉籽糖（3糖），含量仅是总糖量的9％以下，后者用纯天然物理方法提取，水苏糖和棉籽糖含量占总糖量的30％以上。实验证明，肠道内双歧杆菌的增殖作用，主要成份是水苏糖和棉籽糖，由于大豆低聚糖中水苏糖、棉籽糖含量高，大豆低聚糖对双歧杆菌的增殖效果，比其它酶解淀粉低聚糖类高3倍以上。